El “San Lázaro” desde sus inicios estuvo relacionado con el desarrollo histórico y social de la ciudad de Quito desde el siglo XVI.

El 15 de marzo de 1785 se funda el “Hospicio Jesús, María y José” como respuesta a la problemática histórica de ese momento, la contradicción de clases sociales -producto de la gran inestabilidad económica de la época- hacía que más de la mitad de la población esté constituida por indigentes, vagabundos, pordioseros, mendigos y huérfanos que deambulaban por las calles de la Real Audiencia.

En 1786 en un espacio conjunto al Hospicio se funda el “Hospital San Lázaro”. El hospicio en su conjunto cumplió múltiples funciones tales como: orfanatorio, leprosería y manicomio.

Desde su fundación varios fueron los intentos de cambiar su estructura y sistema de atención psiquiátrica coercitiva y custodial, sin resultados satisfactorios. Solo en junio del 2012, es cuando se transforma hacia una atención al paciente con mayor respecto a su humanidad, incluyendo una asistencia comunitaria, descentralizada, participativa, preventiva e integral con la creación del Centro de Atención Ambulatoria Especializado San Lázaro.